Foi criado em 1998, por iniciativa da Fábrica da Igreja, para ser uma instituição de solidariedade social, ao serviço da promoção integral das pessoas. Os seus estatutos foram aprovados a 18 de Outubro de 1998 pelo Sr. Bispo de Angra, D.Aurélio. No entanto, devido a diversas dificuldades, a atividade do Centro de Bem Estar apenas começou concretizar ações a partir de Outubro de 2001, os seus projetos são levados a cabo por meio de parcerias com outras instituições.